彩色玻璃艺术也将12和13世纪的光学技术在巴黎圣母院这个哥特建筑中的一个很伟大的成就之一。这场大火，使得原来的彩色玻璃几乎没有保留，所幸的是有标志性和不可复制性的三朵位于大教堂三个主要入口的玫瑰窗幸存下来。同时这个描绘亚当夏娃的诱惑的小彩色玻璃也是这场劫难中的幸存物。

大概在12世纪的时候，罗马式建筑综合着艺术风格，比如说之前罗马和拜占庭的风格风靡欧洲那会的时候，另一种哥特式在法国盛行并延续了十五世纪。这风格跟罗马教堂不同的点在于深悠的颜色，也和窗户设计有直接的关系。窗户不只是在墙上开一个洞而已，它们开始试图占据墙壁的面积并且延续四周，建筑开始引入。而装饰窗户的彩色玻璃，设计美观，阳光从外面射入，缤纷的色彩透出圣洁的光。
在法国教堂中以彩色玻璃著称的要属沙特尔大教堂为首；它的彩色玻璃是最富有特色的，是选用18幅画面用来衬托中间的一幅画面，这幅画面就是贝依·弗里埃尔圣母画，其余的画面则是阐述耶稣的事迹或是最后的晚餐等主题的，这些彩绘玻璃色彩调配富有对比性，富丽堂皇，美不胜收，是12世纪哥特式彩色玻璃画的杰出作品。
苏格认为狄奥尼修斯实际上是圣但尼的守护神，因此他将神圣之光的概念融入他的建筑计划中，并围绕着彩色玻璃窗设计了新的大教堂，圣丹尼斯修道院教堂成为这种新型建筑的原型，除了被认为是神圣的光之外，彩绘玻璃和哥特式雕塑一起被称为“穷人圣经”的一部分，因为彩绘玻璃的另一个目的是向文盲传授圣经故事
古代埃及和罗马人都擅长制造小型的彩色玻璃制品。古代腓尼基在玻璃制造业中也占有重要地位，其中心产地是西顿和安条克等地。在公元4-5世纪的早期基督教教堂中，一些木质窗框中镶嵌有经雕琢过的雪花石膏，类似玻璃般的效果。公元7世纪，英国的教堂和修道院已经出现了彩绘玻璃窗。公元675年，圣本笃·波斯哥［］从法国引进工匠，为在芒克威尔茅斯建造的圣彼得修道院窗户进行着色。公元8世纪以后，伊斯兰世界的一些清真寺和公共空间也开始以彩色玻璃装饰，基本以纯粹的几何设计为主，包含花卉和文字图案，不表现人物形象和宗教偶像。
英国哥特式教堂的高耸立面与玻璃设计相结合，风格独特而鲜明。而玫瑰窗从相对简单的窗户发展而来，圆形的窗户嵌入彩色玻璃绘画，透光形式绚丽。彩绘玻璃花窗作为教堂采用的一种重要的布道方式，通过人物形象的描绘，向广大识字率低的民众传达《圣经》故事以及历史传奇。